Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
DBX2
Ідентифікатори
Символи
DBX2 , developing brain homeobox 2
Зовнішні ІД
MGI: 107445 HomoloGene: 54981 GeneCards: DBX2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 45.01 – 45.05 Mb
Хр. 15: 95.52 – 95.55 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
DBX2 (англ. Developing brain homeobox 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот , а молекулярна маса — 36 555[ 4] .
Послідовність амінокислот
10
20
30
40
50
MLPSAVAAHA
GAYWDVVASS
ALLNLPAAPG
FGNLGKSFLI
ENLLRVGGAP
TPRLQPPAPH
DPATALATAG
AQLRPLPASP
VPLKLCPAAE
QVSPAGAPYG
TRWAFQVLSP
SADSARLPGR
APGDRDCTFQ
PSAPAPSKPF
LLSTPPFYSA
CCGGSCRRPA
SSTAFPREES
MLPLLTQDSN
SKARRGILRR
AVFSEDQRKA
LEKMFQKQKY
ISKTDRKKLA
INLGLKESQV
KIWFQNRRMK
WRNSKEKEVL
SNRCIQEVGL
QEDPLSRSAL
GFPSPCPSIW
DVPQQHSSPR
WRENSPEPSE
RLIQESSGAP
PPEANSLQGA
LYLCSEEEAG
SKGVLTGAV
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші