Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NFYB
Ідентифікатори
Символи
NFYB , CBF-A, CBF-B, HAP3, NF-YB, nuclear transcription factor Y subunit beta
Зовнішні ІД
OMIM : 189904 MGI: 97317 HomoloGene: 38149 GeneCards: NFYB
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента
• protein-DNA complex • нуклеоплазма • CCAAT-binding factor complex • клітинне ядро • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес
• GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of cholesterol biosynthetic process • cellular response to leukemia inhibitory factor • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 104.12 – 104.14 Mb
Хр. 10: 82.58 – 82.6 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
NFYB (англ. Nuclear transcription factor Y subunit beta ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 207 амінокислот , а молекулярна маса — 22 831[ 4] .
Послідовність амінокислот
10
20
30
40
50
MTMDGDSSTT
DASQLGISAD
YIGGSHYVIQ
PHDDTEDSMN
DHEDTNGSKE
SFREQDIYLP
IANVARIMKN
AIPQTGKIAK
DAKECVQECV
SEFISFITSE
ASERCHQEKR
KTINGEDILF
AMSTLGFDSY
VEPLKLYLQK
FREAMKGEKG
IGGAVTATDG
LSEELTEEAF
TNQLPAGLIT
TDGQQQNVMV
YTTSYQQISG
VQQIQFS
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
Chattopadhyay C., Hawke D., Kobayashi R., Maity S.N. (2004). Human p32, interacts with B subunit of the CCAAT-binding factor, CBF/NF-Y, and inhibits CBF-mediated transcription activation in vitro. Nucleic Acids Res . 32 : 3632—3641. PMID 15243141 doi :10.1093/nar/gkh692
Romier C., Cocchiarella F., Mantovani R., Moras D. (2003). The NF-YB/NF-YC structure gives insight into DNA binding and transcription regulation by CCAAT factor NF-Y . J. Biol. Chem . 278 : 1336—1345. PMID 12401788 doi :10.1074/jbc.M209635200
Li X.-Y., Hooft van Huijsduijnen R., Mantovani R., Benoist C.O., Mathis D. (1992). Intron-exon organization of the NF-Y genes. Tissue-specific splicing modifies an activation domain . J. Biol. Chem . 267 : 8984—8990. PMID 1577736
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші