Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
PHF3 (англ. PHD finger protein 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 039 амінокислот , а молекулярна маса — 229 481[ 4] .
Послідовність амінокислот
10
20
30
40
50
MDIVDTFNHL
IPTEHLDDAL
FLGSNLENEV
CEDFSASQNV
LEDSLKNMLS
DKDPMLGSAS
NQFCLPVLDS
NDPNFQMPCS
TVVGLDDIMD
EGVVKESGND
TIDEEELILP
NRNLRDKVEE
NSVRSPRKSP
RLMAQEQVRS
LRQSTIAKRS
NAAPLSNTKK
ASGKTVSTAK
AGVKQPERSQ
VKEEVCMSLK
PEYHKENRRC
SRNSGQIEVV
PEVSVSSSHS
SVSSCLEMKD
EDGLDSKHKC
NNPGEIDVPS
HELNCSLLSE
TCVTIGEKKN
EALMECKAKP
VGSPLFKFSD
KEEHEQNDSI
SGKTGETVVE
EMIATRKVEQ
DSKETVKLSH
EDDHILEDAG
SSDISSDAAC
TNPNKTENSL
VGLPSCVDEV
TECNLELKDT
MGIADKTENT
LERNKIEPLG
YCEDAESNRQ
LESTEFNKSN
LEVVDTSTFG
PESNILENAI
CDVPDQNSKQ
LNAIESTKIE
SHETANLQDD
RNSQSSSVSY
LESKSVKSKH
TKPVIHSKQN
MTTDAPKKIV
AAKYEVIHSK
TKVNVKSVKR
NTDVPESQQN
FHRPVKVRKK
QIDKEPKIQS
CNSGVKSVKN
QAHSVLKKTL
QDQTLVQIFK
PLTHSLSDKS
HAHPGCLKEP
HHPAQTGHVS
HSSQKQCHKP
QQQAPAMKTN
SHVKEELEHP
GVEHFKEEDK
LKLKKPEKNL
QPRQRRSSKS
FSLDEPPLFI
PDNIATIRRE
GSDHSSSFES
KYMWTPSKQC
GFCKKPHGNR
FMVGCGRCDD
WFHGDCVGLS
LSQAQQMGEE
DKEYVCVKCC
AEEDKKTEIL
DPDTLENQAT
VEFHSGDKTM
ECEKLGLSKH
TTNDRTKYID
DTVKHKVKIL
KRESGEGRNS
SDCRDNEIKK
WQLAPLRKMG
QPVLPRRSSE
EKSEKIPKES
TTVTCTGEKA
SKPGTHEKQE
MKKKKVEKGV
LNVHPAASAS
KPSADQIRQS
VRHSLKDILM
KRLTDSNLKV
PEEKAAKVAT
KIEKELFSFF
RDTDAKYKNK
YRSLMFNLKD
PKNNILFKKV
LKGEVTPDHL
IRMSPEELAS
KELAAWRRRE
NRHTIEMIEK
EQREVERRPI
TKITHKGEIE
IESDAPMKEQ
EAAMEIQEPA
ANKSLEKPEG
SEKQKEEVDS
MSKDTTSQHR
QHLFDLNCKI
CIGRMAPPVD
DLSPKKVKVV
VGVARKHSDN
EAESIADALS
STSNILASEF
FEEEKQESPK
STFSPAPRPE
MPGTVEVEST
FLARLNFIWK
GFINMPSVAK
FVTKAYPVSG
SPEYLTEDLP
DSIQVGGRIS
PQTVWDYVEK
IKASGTKEIC
VVRFTPVTEE
DQISYTLLFA
YFSSRKRYGV
AANNMKQVKD
MYLIPLGATD
KIPHPLVPFD
GPGLELHRPN
LLLGLIIRQK
LKRQHSACAS
TSHIAETPES
APPIALPPDK
KSKIEVSTEE
APEEENDFFN
SFTTVLHKQR
NKPQQNLQED
LPTAVEPLME
VTKQEPPKPL
RFLPGVLIGW
ENQPTTLELA
NKPLPVDDIL
QSLLGTTGQV
YDQAQSVMEQ
NTVKEIPFLN
EQTNSKIEKT
DNVEVTDGEN
KEIKVKVDNI
SESTDKSAEI
ETSVVGSSSI
SAGSLTSLSL
RGKPPDVSTE
AFLTNLSIQS
KQEETVESKE
KTLKRQLQED
QENNLQDNQT
SNSSPCRSNV
GKGNIDGNVS
CSENLVANTA
RSPQFINLKR
DPRQAAGRSQ
PVTTSESKDG
DSCRNGEKHM
LPGLSHNKEH
LTEQINVEEK
LCSAEKNSCV
QQSDNLKVAQ
NSPSVENIQT
SQAEQAKPLQ
EDILMQNIET
VHPFRRGSAV
ATSHFEVGNT
CPSEFPSKSI
TFTSRSTSPR
TSTNFSPMRP
QQPNLQHLKS
SPPGFPFPGP
PNFPPQSMFG
FPPHLPPPLL
PPPGFGFAQN
PMVPWPPVVH
LPGQPQRMMG
PLSQASRYIG
PQNFYQVKDI
RRPERRHSDP
WGRQDQQQLD
RPFNRGKGDR
QRFYSDSHHL
KRERHEKEWE
QESERHRRRD
RSQDKDRDRK
SREEGHKDKE
RARLSHGDRG
TDGKASRDSR
NVDKKPDKPK
SEDYEKDKER
EKSKHREGEK
DRDRYHKDRD
HTDRTKSKR
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші