Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
KLF3
Ідентифікатори
Символи
KLF3 , BKLF, Kruppel-like factor 3 (basic), Kruppel like factor 3
Зовнішні ІД
OMIM : 609392 MGI: 1342773 HomoloGene: 7396 GeneCards: KLF3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес
• multicellular organism development • cellular response to peptide • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 4: 38.66 – 38.7 Mb
Хр. 5: 64.96 – 64.99 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
KLF3 (англ. Kruppel like factor 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 345 амінокислот , а молекулярна маса — 38 829[ 4] .
Послідовність амінокислот
10
20
30
40
50
MLMFDPVPVK
QEAMDPVSVS
YPSNYMESMK
PNKYGVIYST
PLPEKFFQTP
EGLSHGIQME
PVDLTVNKRS
SPPSAGNSPS
SLKFPSSHRR
ASPGLSMPSS
SPPIKKYSPP
SPGVQPFGVP
LSMPPVMAAA
LSRHGIRSPG
ILPVIQPVVV
QPVPFMYTSH
LQQPLMVSLS
EEMENSSSSM
QVPVIESYEK
PISQKKIKIE
PGIEPQRTDY
YPEEMSPPLM
NSVSPPQALL
QENHPSVIVQ
PGKRPLPVES
PDTQRKRRIH
RCDYDGCNKV
YTKSSHLKAH
RRTHTGEKPY
KCTWEGCTWK
FARSDELTRH
FRKHTGIKPF
QCPDCDRSFS
RSDHLALHRK
RHMLV
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , поліморфізм, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші