Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ZFHX3
Ідентифікатори
Символи
ZFHX3 , ATBF1, ATBT, ZNF927, zinc finger homeobox 3
Зовнішні ІД
OMIM : 104155 MGI: 99948 HomoloGene: 21366 GeneCards: ZFHX3
Пов'язані генетичні захворювання
інсульт , ішемічна хвороба серця , синдром Кавасакі , цереброваскулярні хвороби [1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • enzyme binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • ядерні тільця • transcription regulator complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес
• negative regulation of myoblast differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of locomotor rhythm • muscle organ development • transcription by RNA polymerase II • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of myoblast differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • response to transforming growth factor beta • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • brain development • regulation of neuron differentiation • positive regulation of cell adhesion • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 16: 72.78 – 73.89 Mb
Хр. 8: 108.67 – 109.69 Mb
PubMed search
[2]
[3] Вікідані
ZFHX3 (англ. Zinc finger homeobox 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 703 амінокислот , а молекулярна маса — 404 419[5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEGCDSPVVS GKDNGCGIPQ HQQWTELNST HLPDKPSSME QSTGESHGPL
DSLRAPFNER LAESTASAGP PSEPASKEVT CNECSASFAS LQTYMEHHCP
SARPPPPLRE ESASDTGEEG DEESDVENLA GEIVYQPDGS AYIVESLSQL
TQGGGACGSG SGSGPLPSLF LNSLPGAGGK QGDPSCAAPV YPQIINTFHI
ASSFGKWFEG PDQAFPNTSA LAGLSPVLHS FRVFDVRHKS NKDYLNSDGS
AKSSCVSKDV PNNVDLSKFD GFVLYGKRKP ILMCFLCKLS FGYVRSFVTH
AVHDHRMTLS EDERKILSNK NISAIIQGIG KDKEPLVSFL EPKNKNFQHP
LVSTANLIGP GHSFYGKFSG IRMEGEEALP AGSAAGPEQP QAGLLTPSTL
LNLGGLTSSV LKTPITSVPL GPLASSPTKS SEGKDSGAAE GEKQEVGDGD
CFSEKVEPAE EEAEEEEEEE EAEEEEEEEE EEEEEEEDEG CKGLFPSELD
EELEDRPHEE PGAAAGSSSK KDLALSNQSI SNSPLMPNVL QTLSRGTAST
SSNSASSFVV FDGANRRNRL SFNSEGVRAN VAEGGRRLDF ADESANKDNA
TAPEPNESTE GDDGGFVPHH QHAGSLCELG VGECPSGSGV ECPKCDTVLG
SSRSLGGHMT MMHSRNSCKT LKCPKCNWHY KYQQTLEAHM KEKHPEPGGS
CVYCKSGQPH PRLARGESYT CGYKPFRCEV CNYSTTTKGN LSIHMQSDKH
LNNMQNLQNG GGEQVFSHTA GAAAAAVAAA AAAANISSSC GAPSPTKPKT
KPTWRCEVCD YETNVARNLR IHMTSEKHMH NMMLLQQNMT QIQHNRHLGL
GSLPSPAEAE LYQYYLAQNM NLPNLKMDSA ASDAQFMMSG FQLDPAGPMA
AMTPALVGGE IPLDMRLGGG QLVSEELMNL GESFIQTNDP SLKLFQCAVC
NKFTTDNLDM LGLHMNVERS LSEDEWKAVM GDSYQCKLCR YNTQLKANFQ
LHCKTDKHVQ KYQLVAHIKE GGKANEWRLK CVAIGNPVHL KCNACDYYTN
SLEKLRLHTV NSRHEASLKL YKHLQQHESG VEGESCYYHC VLCNYSTKAK
LNLIQHVRSM KHQRSESLRK LQRLQKGLPE EDEDLGQIFT IRRCPSTDPE
EAIEDVEGPS ETAADPEELA KDQEGGASSS QAEKELTDSP ATSKRISFPG
SSESPLSSKR PKTAEEIKPE QMYQCPYCKY SNADVNRLRV HAMTQHSVQP
MLRCPLCQDM LNNKIHLQLH LTHLHSVAPD CVEKLIMTVT TPEMVMPSSM
FLPAAVPDRD GNSNLEEAGK QPETSEDLGK NILPSASTEQ SGDLKPSPAD
PGSVREDSGF ICWKKGCNQV FKTSAALQTH FNEVHAKRPQ LPVSDRHVYK
YRCNQCSLAF KTIEKLQLHS QYHVIRAATM CCLCQRSFRT FQALKKHLET
SHLELSEADI QQLYGGLLAN GDLLAMGDPT LAEDHTIIVE EDKEEESDLE
DKQSPTGSDS GSVQEDSGSE PKRALPFRKG PNFTMEKFLD PSRPYKCTVC
KESFTQKNIL LVHYNSVSHL HKLKRALQES ATGQPEPTSS PDNKPFKCNT
CNVAYSQSST LEIHMRSVLH QTKARAAKLE AASGSSNGTG NSSSISLSSS
TPSPVSTSGS NTFTTSNPSS AGIAPSSNLL SQVPTESVGM PPLGNPIGAN
IASPSEPKEA NRKKLADMIA SRQQQQQQQQ QQQQQQQQQQ QAQTLAQAQA
QVQAHLQQEL QQQAALIQSQ LFNPTLLPHF PMTTETLLQL QQQQHLLFPF
YIPSAEFQLN PEVSLPVTSG ALTLTGTGPG LLEDLKAQVQ VPQQSHQQIL
PQQQQNQLSI AQSHSALLQP SQHPEKKNKL VIKEKEKESQ RERDSAEGGE
GNTGPKETLP DALKAKEKKE LAPGGGSEPS MLPPRIASDA RGNATKALLE
NFGFELVIQY NENKQKVQKK NGKTDQGENL EKLECDSCGK LFSNILILKS
HQEHVHQNYF PFKQLERFAK QYRDHYDKLY PLRPQTPEPP PPPPPPPPPP
LPAAPPQPAS TPAIPASAPP ITSPTIAPAQ PSVPLTQLSM PMELPIFSPL
MMQTMPLQTL PAQLPPQLGP VEPLPADLAQ LYQHQLNPTL LQQQNKRPRT
RITDDQLRVL RQYFDINNSP SEEQIKEMAD KSGLPQKVIK HWFRNTLFKE
RQRNKDSPYN FSNPPITSLE ELKIDSRPPS PEPPKQEYWG SKRSSRTRFT
DYQLRVLQDF FDANAYPKDD EFEQLSNLLN LPTRVIVVWF QNARQKARKN
YENQGEGKDG ERRELTNDRY IRTSNLNYQC KKCSLVFQRI FDLIKHQKKL
CYKDEDEEGQ DDSQNEDSMD AMEILTPTSS SCSTPMPSQA YSAPAPSANN
TASSAFLQLT AEAEELATFN SKTEAGDEKP KLAEAPSAQP NQTQEKQGQP
KPELQQQEQP EQKTNTPQQK LPQLVSLPSL PQPPPQAPPP QCPLPQSSPS
PSQLSHLPLK PLHTSTPQQL ANLPPQLIPY QCDQCKLAFP SFEHWQEHQQ
LHFLSAQNQF IHPQFLDRSL DMPFMLFDPS NPLLASQLLS GAIPQIPASS
ATSPSTPTST MNTLKRKLEE KASASPGEND SGTGGEEPQR DKRLRTTITP
EQLEILYQKY LLDSNPTRKM LDHIAHEVGL KKRVVQVWFQ NTRARERKGQ
FRAVGPAQAH RRCPFCRALF KAKTALEAHI RSRHWHEAKR AGYNLTLSAM
LLDCDGGLQM KGDIFDGTSF SHLPPSSSDG QGVPLSPVSK TMELSPRTLL
SPSSIKVEGI EDFESPSMSS VNLNFDQTKL DNDDCSSVNT AITDTTTGDE
GNADNDSATG IATETKSSSA PNEGLTKAAM MAMSEYEDRL SSGLVSPAPS
FYSKEYDNEG TVDYSETSSL ADPCSPSPGA SGSAGKSGDS GDRPGQKRFR
TQMTNLQLKV LKSCFNDYRT PTMLECEVLG NDIGLPKRVV QVWFQNARAK
EKKSKLSMAK HFGINQTSYE GPKTECTLCG IKYSARLSVR DHIFSQQHIS
KVKDTIGSQL DKEKEYFDPA TVRQLMAQQE LDRIKKANEV LGLAAQQQGM
FDNTPLQALN LPTAYPALQG IPPVLLPGLN SPSLPGFTPS NTALTSPKPN
LMGLPSTTVP SPGLPTSGLP NKPSSASLSS PTPAQATMAM GPQQPPQQQQ
QQQQPQVQQP PPPPAAQPPP TPQLPLQQQQ QRKDKDSEKV KEKEKAHKGK
GEPLPVPKKE KGEAPTATAA TISAPLPTME YAVDPAQLQA LQAALTSDPT
ALLTSQFLPY FVPGFSPYYA PQIPGALQSG YLQPMYGMEG LFPYSPALSQ
ALMGLSPGSL LQQYQQYQQS LQEAIQQQQQ RQLQQQQQQK VQQQQPKASQ
TPVPPGAPSP DKDPAKESPK PEEQKNTPRE VSPLLPKLPE EPEAESKSAD
SLYDPFIVPK VQYKLVCRKC QAGFSDEEAA RSHLKSLCFF GQSVVNLQEM
VLHVPTGGGG GGSGGGGGGG GGGGGGGSYH CLACESALCG EEALSQHLES
ALHKHRTITR AARNAKEHPS LLPHSACFPD PSTASTSQSA AHSNDSPPPP
SAAAPSSASP HASRKSWPQV VSRASAAKPP SFPPLSSSST VTSSSCSTSG
VQPSMPTDDY SEESDTDLSQ KSDGPASPVE GPKDPSCPKD SGLTSVGTDT
FRL
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , міогенез, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші