SYNM (англ. Synemin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 565 амінокислот, а молекулярна маса — 172 768[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MLSWRLQTGP | EKAELQELNA | RLYDYVCRVR | ELERENLLLE | EELRGRRGRE | ||||
GLWAEGQARC | AEEARSLRQQ | LDELSWATAL | AEGERDALRR | ELRELQRLDA | ||||
EERAARGRLD | AELGAQQREL | QEALGARAAL | EALLGRLQAE | RRGLDAAHER | ||||
DVRELRARAA | SLTMHFRARA | TGPAAPPPRL | REVHDSYALL | VAESWRETVQ | ||||
LYEDEVRELE | EALRRGQESR | LQAEEETRLC | AQEAEALRRE | ALGLEQLRAR | ||||
LEDALLRMRE | EYGIQAEERQ | RAIDCLEDEK | ATLTLAMADW | LRDYQDLLQV | ||||
KTGLSLEVAT | YRALLEGESN | PEIVIWAEHV | ENMPSEFRNK | SYHYTDSLLQ | ||||
RENERNLFSR | QKAPLASFNH | SSALYSNLSG | HRGSQTGTSI | GGDARRGFLG | ||||
SGYSSSATTQ | QENSYGKAVS | SQTNVRTFSP | TYGLLRNTEA | QVKTFPDRPK | ||||
AGDTREVPVY | IGEDSTIARE | SYRDRRDKVA | AGASESTRSN | ERTVILGKKT | ||||
EVKATREQER | NRPETIRTKP | EEKMFDSKEK | ASEERNLRWE | ELTKLDKEAR | ||||
QRESQQMKEK | AKEKDSPKEK | SVREREVPIS | LEVSQDRRAE | VSPKGLQTPV | ||||
KDAGGGTGRE | AEARELRFRL | GTSDATGSLQ | GDSMTETVAE | NIVTSILKQF | ||||
TQSPETEASA | DSFPDTKVTY | VDRKELPGER | KTKTEIVVES | KLTEDVDVSD | ||||
EAGLDYLLSK | DIKEVGLKGK | SAEQMIGDII | NLGLKGREGR | AKVVNVEIVE | ||||
EPVSYVSGEK | PEEFSVPFKV | EEVEDVSPGP | WGLVKEEEGY | GESDVTFSVN | ||||
QHRRTKQPQE | NTTHVEEVTE | AGDSEGEQSY | FVSTPDEHPG | GHDRDDGSVY | ||||
GQIHIEEEST | IRYSWQDEIV | QGTRRRTQKD | GAVGEKVVKP | LDVPAPSLEG | ||||
DLGSTHWKEQ | ARSGEFHAEP | TVIEKEIKIP | HEFHTSMKGI | SSKEPRQQLV | ||||
EVIGQLEETL | PERMREELSA | LTREGQGGPG | SVSVDVKKVQ | GAGGSSVTLV | ||||
AEVNVSQTVD | ADRLDLEELS | KDEASEMEKA | VESVVRESLS | RQRSPAPGSP | ||||
DEEGGAEAPA | AGIRFRRWAT | RELYIPSGES | EVAGGASHSS | GQRTPQGPVS | ||||
ATVEVSSPTG | FAQSQVLEDV | SQAARHIKLG | PSEVWRTERM | SYEGPTAEVV | ||||
EVSAGGDLSQ | AASPTGASRS | VRHVTLGPGQ | SPLSREVIFL | GPAPACPEAW | ||||
GSPEPGPAES | SADMDGSGRH | STFGCRQFHA | EKEIIFQGPI | SAAGKVGDYF | ||||
ATEESVGTQT | SVRQLQLGPK | EGFSGQIQFT | APLSDKVELG | VIGDSVHMEG | ||||
LPGSSTSIRH | ISIGPQRHQT | TQQIVYHGLV | PQLGESGDSE | STVHGEGSAD | ||||
VHQATHSHTS | GRQTVMTEKS | TFQSVVSESP | QEDSAGDTSG | AEMTSGVSRS | ||||
FRHIRLGPTE | TETSEHIAIR | GPVSRTFVLA | GSADSPELGK | LADSSRTLRH | ||||
IAPGPKETSF | TFQMDVSNVE | AIRSRTQEAG | ALGVSDRGSW | RDADSRNDQA | ||||
VGVSFKASAG | EGDQAHREQG | KEQAMFDKKV | QLQRMVDQRS | VISDEKKVAL | ||||
LYLDNEEEEN | DGHWF |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, проміжних філаментах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bhosle R.C., Michele D.E., Campbell K.P., Li Z., Robson R.M. (2006). Interactions of intermediate filament protein synemin with dystrophin and utrophin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 346: 768—777. PMID 16777071 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.05.192
- Sun N., Critchley D.R., Paulin D., Li Z., Robson R.M. (2008). Human alpha-synemin interacts directly with vinculin and metavinculin. Biochem. J. 409: 657—667. PMID 18028034 DOI:10.1042/BJ20071188
- Sun N., Critchley D.R., Paulin D., Li Z., Robson R.M. (2008). Identification of a repeated domain within mammalian alpha-synemin that interacts directly with talin. Exp. Cell Res. 314: 1839—1849. PMID 18342854 DOI:10.1016/j.yexcr.2008.01.034
- Mizuno Y., Puca A.A., O'Brien K.F., Beggs A.H., Kunkel L.M. (2001). Genomic organization and single-nucleotide polymorphism map of desmuslin, a novel intermediate filament protein on chromosome 15q26.3. BMC Genet. 2: 8—8. PMID 11454237 DOI:10.1186/1471-2156-2-8
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24466 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-28 у Wayback Machine.]
- ↑ UniProt, O15061 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |