COPS6

COPS6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4D10, 4D18, 4QFT, 4R14, 4WSN
Ідентифікатори
Символи	COPS6, CSN6, MOV34-34KD, COP9 signalosome subunit 6
Зовнішні ІД	OMIM: 614729 MGI: 1349439 HomoloGene: 4977 GeneCards: COPS6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • COP9 signalosome; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• transcription-coupled nucleotide-excision repair; • GO:0022415 viral process; • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition; • protein deneddylation; • посттрансляційна модифікація;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	10980
	26893
	ENSG00000168090
	ENSMUSG00000019494
	Q7L5N1
	O88545
	NM_006833
	NM_012002
	NP_006824
	NP_036132
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COPS6 (англ. COP9 signalosome subunit 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 327 амінокислот, а молекулярна маса — 36 163^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAAAAAAAA	TNGTGGSSGM	EVDAAVVPSV	MACGVTGSVS	VALHPLVILN
ISDHWIRMRS	QEGRPVQVIG	ALIGKQEGRN	IEVMNSFELL	SHTVEEKIII
DKEYYYTKEE	QFKQVFKELE	FLGWYTTGGP	PDPSDIHVHK	QVCEIIESPL
FLKLNPMTKH	TDLPVSVFES	VIDIINGEAT	MLFAELTYTL	ATEEAERIGV
DHVARMTATG	SGENSTVAEH	LIAQHSAIKM	LHSRVKLILE	YVKASEAGEV
PFNHEILREA	YALCHCLPVL	STDKFKTDFY	DQCNDVGLMA	YLGTITKTCN
TMNQFVNKFN	VLYDRQGIGR	RMRGLFF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hoareau Alves K., Bochard V., Rety S., Jalinot P. (2002). Association of the mammalian proto-oncoprotein Int-6 with the three protein complexes eIF3, COP9 signalosome and 26S proteasome. FEBS Lett. 527: 15—21. PMID 12220626 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03147-2
Ramanathan M.P., Curley E. III, Su M., Chambers J.A., Weiner D.B. (2002). Carboxyl terminus of hVIP/mov34 is critical for HIV-1-Vpr interaction and glucocorticoid-mediated signaling. J. Biol. Chem. 277: 47854—47860. PMID 12237292 DOI:10.1074/jbc.M203905200
Zhao L.-J., Mukherjee S., Narayan O. (1994). Biochemical mechanism of HIV-I Vpr function. Specific interaction with a cellular protein. J. Biol. Chem. 269: 15577—15582. PMID 8195203

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21749 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q7L5N1 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21749 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q7L5N1 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]