COPA

COPA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5A1U, 5A1V, 5A1W, 5A1X, 5A1Y
Ідентифікатори
Символи	COPA, HEP-COP, AILJK, coatomer protein complex subunit alpha, alpha-COP, COPI coat complex subunit alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 601924 MGI: 1334462 HomoloGene: 3218 GeneCards: COPA
Онтологія гена
Молекулярна функція	• hormone activity; • structural molecule activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • комплекс Ґольджі; • мембрана; • Golgi membrane; • COPI-coated vesicle membrane; • transport vesicle; • extracellular region; • membrane coat; • COPI vesicle coat; • екзосома; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • endoplasmic reticulum membrane; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum; • pancreatic juice secretion; • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; • protein transport; • intracellular protein transport; • intra-Golgi vesicle-mediated transport; • vesicle-mediated transport; • GO:0015915 транспорт; • regulation of signaling receptor activity; • GO:0072468 сигнальна трансдукція;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	1314
	12847
	н/д
	ENSMUSG00000026553
	P53621
	Q8CIE6
	NM_004371; NM_001098398
	NM_009938
	NP_001091868; NP_004362
	NP_034068
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COPA (англ. Coatomer protein complex subunit alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 224 амінокислот, а молекулярна маса — 138 346^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLTKFETKSA	RVKGLSFHPK	RPWILTSLHN	GVIQLWDYRM	CTLIDKFDEH
DGPVRGIDFH	KQQPLFVSGG	DDYKIKVWNY	KLRRCLFTLL	GHLDYIRTTF
FHHEYPWILS	ASDDQTIRVW	NWQSRTCVCV	LTGHNHYVMC	AQFHPTEDLV
VSASLDQTVR	VWDISGLRKK	NLSPGAVESD	VRGITGVDLF	GTTDAVVKHV
LEGHDRGVNW	AAFHPTMPLI	VSGADDRQVK	IWRMNESKAW	EVDTCRGHYN
NVSCAVFHPR	QELILSNSED	KSIRVWDMSK	RTGVQTFRRD	HDRFWVLAAH
PNLNLFAAGH	DGGMIVFKLE	RERPAYAVHG	NMLHYVKDRF	LRQLDFNSSK
DVAVMQLRSG	SKFPVFNMSY	NPAENAVLLC	TRASNLENST	YDLYTIPKDA
DSQNPDAPEG	KRSSGLTAVW	VARNRFAVLD	RMHSLLIKNL	KNEITKKVQV
PNCDEIFYAG	TGNLLLRDAD	SITLFDVQQK	RTLASVKISK	VKYVIWSADM
SHVALLAKHA	IVICNRKLDA	LCNIHENIRV	KSGAWDESGV	FIYTTSNHIK
YAVTTGDHGI	IRTLDLPIYV	TRVKGNNVYC	LDRECRPRVL	TIDPTEFKFK
LALINRKYDE	VLHMVRNAKL	VGQSIIAYLQ	KKGYPEVALH	FVKDEKTRFS
LALECGNIEI	ALEAAKALDD	KNCWEKLGEV	ALLQGNHQIV	EMCYQRTKNF
DKLSFLYLIT	GNLEKLRKMM	KIAEIRKDMS	GHYQNALYLG	DVSERVRILK
NCGQKSLAYL	TAATHGLDEE	AESLKETFDP	EKETIPDIDP	NAKLLQPPAP
IMPLDTNWPL	LTVSKGFFEG	TIASKGKGGA	LAADIDIDTV	GTEGWGEDAE
LQLDEDGFVE	ATEGLGDDAL	GKGQEEGGGW	DVEEDLELPP	ELDISPGAAG
GAEDGFFVPP	TKGTSPTQIW	CNNSQLPVDH	ILAGSFETAM	RLLHDQVGVI
QFGPYKQLFL	QTYARGRTTY	QALPCLPSMY	GYPNRNWKDA	GLKNGVPAVG
LKLNDLIQRL	QLCYQLTTVG	KFEEAVEKFR	SILLSVPLLV	VDNKQEIAEA
QQLITICREY	IVGLSVETER	KKLPKETLEQ	QKRICEMAAY	FTHSNLQPVH
MILVLRTALN	LFFKLKNFKT	AATFARRLLE	LGPKPEVAQQ	TRKILSACEK
NPTDAYQLNY	DMHNPFDICA	ASYRPIYRGK	PVEKCPLSGA	CYSPEFKGQI
CRVTTVTEIG	KDVIGLRISP	LQFR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гормонів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті Гольджі. Також секретований назовні.

Література

Chow V.T.K., Quek H.H. (1996). HEP-COP, a novel human gene whose product is highly homologous to the alpha-subunit of the yeast coatomer protein complex. Gene. 169: 223—227. PMID 8647451 DOI:10.1016/0378-1119(95)00738-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chow V.T.K., Quek H.H. (1997). Alpha coat protein COPA (HEP-COP): presence of an Alu repeat in cDNA and identity of the amino terminus to xenin. Ann. Hum. Genet. 61: 369—373. PMID 9365789 DOI:10.1017/S0003480097006295
Feurle G.E. (1998). Xenin -- a review. Peptides. 19: 609—615. PMID 9533652 DOI:10.1016/S0196-9781(97)00378-1
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Feurle G.E., Hamscher G., Kusiek R., Meyer H.E., Metzger J.W. (1992). Identification of xenin, a xenopsin-related peptide, in the human gastric mucosa and its effect on exocrine pancreatic secretion. J. Biol. Chem. 267: 22305—22309. PMID 1429581

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2230 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P53621 (англ.) . Архів оригіналу за 6 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2230 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P53621 (англ.) . Архів оригіналу за 6 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]