ANKS1A

ANKS1A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2LMR, 2MYQ
Ідентифікатори
Символи	ANKS1A, ANKS1, ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A
Зовнішні ІД	OMIM: 608994 MGI: 2446180 HomoloGene: 9068 GeneCards: ANKS1A
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння, недрібноклітинна карцинома легенів, ішемічна хвороба серця
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ephrin receptor binding;
Клітинна компонента	• neuron projection; • cell projection; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• ephrin receptor signaling pathway; • neuron remodeling; • substrate-dependent cell migration; • regulation of ephrin receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	23294
	224650
	ENSG00000064999
	ENSMUSG00000024219
	Q92625
	P59672
	NM_015245
	NM_001286040; NM_001286041; NM_181413; NM_001374802
	NP_056060
	NP_001272969; NP_001272970; NP_852078
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ANKS1A (англ. Ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 134 амінокислот, а молекулярна маса — 123 108^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKEQELLEA	ARTGHLPAVE	KLLSGKRLSS	GFGGGGGGGS	GGGGGGSGGG
GGGLGSSSHP	LSSLLSMWRG	PNVNCVDSTG	YTPLHHAALN	GHKDVVEVLL
RNDALTNVAD	SKGCYPLHLA	AWKGDAQIVR	LLIHQGPSHT	RVNEQNNDNE
TALHCAAQYG	HTEVVKVLLE	ELTDPTMRNN	KFETPLDLAA	LYGRLEVVKM
LLNAHPNLLS	CNTKKHTPLH	LAARNGHKAV	VQVLLDAGMD	SNYQTEMGSA
LHEAALFGKT	DVVQILLAAG	TDVNIKDNHG	LTALDTVREL	PSQKSQQIAA
LIEDHMTGKR	STKEVDKTPP	PQPPLISSMD	SISQKSQGDV	EKAVTELIID
FDANAEEEGP	YEALYNAISC	HSLDSMASGR	SSDQDSTNKE	AEAAGVKPAG
VRPRERPPPP	AKPPPDEEEE	DHIDKKYFPL	TASEVLSMRP	RIHGSAAREE
DEHPYELLLT	AETKKVVLVD	GKTKDHRRSS	SSRSQDSAEG	QDGQVPEQFS
GLLHGSSPVC	EVGQDPFQLL	CTAGQSHPDG	SPQQGACHKA	SMQLEETGVH
APGASQPSAL	DQSKRVGYLT	GLPTTNSRSH	PETLTHTASP	HPGGAEEGDR
SGARSRAPPT	SKPKAELKLS	RSLSKSDSDL	LTCSPTEDAT	MGSRSESLSN
CSIGKKRLEK	SPSFASEWDE	IEKIMSSIGE	GIDFSQERQK	ISGLRTLEQS
VGEWLESIGL	QQYESKLLLN	GFDDVHFLGS	NVMEEQDLRD	IGISDPQHRR
KLLQAARSLP	KVKALGYDGN	SPPSVPSWLD	SLGLQDYVHS	FLSSGYSSID
TVKNLWELEL	VNVLKVQLLG	HRKRIIASLA	DRPYEEPPQK	PPRFSQLRCQ
DLLSQTSSPL	SQNDSCTGRS	ADLLLPPGDT	GRRRHDSLHD	PAAPSRAERF
RIQEEHREAK	LTLRPPSLAA	PYAPVQSWQH	QPEKLIFESC	GYEANYLGSM
LIKDLRGTES	TQDACAKMRK	STEHMKKIPT	IILSITYKGV	KFIDASNKNV
IAEHEIRNIS	CAAQDPEDLC	TFAYITKDLQ	TSHHYCHVFS	TVDVNLTYEI
ILTLGQAFEV	AYQLALQAQK	SRATGASAAE	MIETKSSKPV	PKPRVGVRKS
ALEPPDMDQD	AQSHASVSWV	VDPKPDSKRS	LSTN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Shin J., Gu C., Park E., Park S. (2007). Identification of phosphotyrosine binding domain-containing proteins as novel downstream targets of the EphA8 signaling function. Mol. Cell. Biol. 27: 8113—8126. PMID 17875921 DOI:10.1128/MCB.00794-07

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ANKS1A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20961 (англ.) . Архів оригіналу за 26 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-26 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q92625 (англ.) . Архів оригіналу за 21 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ANKS1A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20961 (англ.) . Архів оригіналу за 26 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-26 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q92625 (англ.) . Архів оригіналу за 21 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]